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片岡 剛文かたおか たかふみ
プロフィール
| 所属 | 海洋生物資源学部 / 海洋生物資源学科 |
|---|---|
| 職名 | 教授 |
| 研究室 | 海洋生物資源学部棟703号室 (内線 1703) |
| kataoka (末尾に「@g.fpu.ac.jp」をつけてください) | |
| ウェブサイト | https://taklab.web.fc2.com |
| 最終学歴 | 北海道大学環境科学院環境起学専攻 博士後期課程修了 |
| 学位 | 博士（環境科学）（北海道大学 2008年） |
| 所属学会 | 日本微生物生態学会 日本海洋学会 日本陸水学会 日本地球惑星連合 NGS現場の会 |
| 職歴 | 2009 福井県立大学 ポスドク研究員 2010 香港科技大学 ポスドク研究員 2011 福井県立大学 プロジェクト博士研究員 2012 愛媛大学 特定研究員 2014 国立環境研究所 特別研究員 |
研究活動
| 専門 | 微生物生態学 |
|---|---|
| 研究活動の紹介 | 環境中には様々な代謝能力を有する微生物が集まり群集を形成しています。これらの微生物は生態系における物質循環に大きな影響を与えていることが知られています。私は、異なる環境中の微生物群集組成や代謝経路を明らかにしながら、環境変動が生態系内の物質循環に与える影響を解明したいと考えています。 |
| キーワード | 微生物生態学 海洋性微生物 分子生物学 嫌気・好気培養 バイオインフォマティクス |
著書・論文
Ruji KONDO* and Takafumi KATAOKA, 「Kamagatella elastica gen. nov., sp. nov., an anaerobic bacterium representing the novel family Kamagatellaceae fam. nov. within the order Tissierellales, isolated from a xenic culture of an anaerobic bacterivorous protist」, 『Antonie van Leeuwenhoek』, 2026, Accepted on April 1, 2026.
日向湖の堆積物から原生生物を培養する過程で単離された絶対嫌気性の細菌を新属新種（Kamagatella elastica）として提案しました。近縁のいずれの"科（family）"と類似しなかったので、新しい科レベルの分類（Kamagatellaceae）も同時に提案しました。elastica（弾性がある）という種名は、"伸びてから分裂する"という独特な増殖様式に基づいています。ゲノム分析全般に関わりました。
Takafumi KATAOKA*, Yuki Sato-TAKABE, Yunosuke NAKAMURA, Takuhei SHIOZAKI, Yuya TSUKAMOTO and Satoshi HANADA, 「Seasonal variation in bacterial community composition in the brackish meromictic Lake Suigetsu」, 『 Antonie van Leeuwenhoek』, 2026, vol.119:1, 10.1007/s10482-025-02212-7.
2018年に実施した首都大学東京のチームとの共同研究で三方五湖における細菌群集構造を調査した研究。水月湖の細菌群集構造を4季節・3水深・異なる粒子サイズの3つで比較した研究です。これまでは、硫黄代謝細菌やシアノバクテリアなど特定の種類を対象とした研究が行われてきましたが、本研究では、16S rRNA遺伝子をマーカーとして細菌の種類を区別せず網羅的に調べました。水月湖の細菌群集の全体像だけでなく、秋に淡水と共に特定の細菌が水月湖の深層にまで流入する現象が確認されました。
Tatsuya KISHIKAMI, Marina OTA, Kasumi ISHIDA, Kazumasa YAMADA, and Takafumi KATAOKA*, 「Morphology and ultrastructure of marine bacterivorous bicosoecid Hirugamonas aperieos gen. et sp. nov.」, 『 Protist』,2025, vol.178:126104. , 10.1016/j.protis.2025.126104.
2016年に日向湖（三方五湖、福井県）から単離培養されたStramenopilesに属する細菌補食原生生物HIYC8株の細胞内微細構造と18S rRNA遺伝子解析により分析し、Bicosoecid目の新属新種として提案しました。捕食口辺縁部内の微小管が6～8本と比較的少ないことおよび、捕食口の片側が大きく開くことから「日向湖から単離された、大きく開く単細胞生物」という意味のHirugamonoas aperioesと命名しました。2019～2021年度の3名の卒論研究の成果です。
Takafumi KATAOKA*, Takehiro NAKAMURA, Ippei MIKI, and Rei SOMIYA 「Spatiotemporal distributions of inorganic nutrients in a hypoxia forming saline lake, Lake Hiruga in Japan」, 『Limnoogy』, 2025, Vol.26, pp. 311–322.
2019年に着手した日本海側にある日向湖（福井県）の栄養塩類をモニタリングした研究論文が国際誌Limnologyに公開されました。日向湖は淡水の流入が制限されている特殊な海水湖です。季節的に発生する嫌気水塊の維持が降水による表層への淡水流入に起因することを示しました。また、嫌気水塊周辺での栄養塩類の濃度分布について考察しました。 研究室の卒業論文を含む初めての成果です。
Takafumi KATAOKA*, Ryo SUGIMOTO, Atsushi KANEDA, Haruyo YAMAGUCHI, Takahito RIHEI and Shinya YAMASHITA, 「Seasonal variation in the community distribution of protists off Wakasa Bay, Southern Sea of Japan」, 『Continental Shelf Research』, 2023 vol.253(15):104898.
2016年から2018年にかけて福井県立大学と福井水産試験場で実施した、若狭湾のモニタリングプロジェクトの成果。若狭湾を縦断して真核微生物の4季分布を調べた研究です。通年優占する種類は、渦鞭毛藻類（Dinoflagellata）に加えて緑藻（Chlorophyta）であることが明らかになりました。Chlorophytaでは、未培養系統とされてきたprasinophyte Clade VIIが夏季から秋季にかけて優占していましたが、Pycnococcus類、Ostreococcus類、Mamiellophyceae類は冬季から春季にかけて優占するという違いが認められました。
Takafumi KATAOKA and Ryuji KONDO*, 「Genome sequence of the sulphate-reducing bacterium, Pseudodesulfovibrio portus JCM 14722T」, 『Microbiology Resource Announcements』, 2022 vol.11(12):e0094722.
硫酸還元菌のタイプ種、Pseudodesulfovibrio portus JCM 14722Tの全ゲノム配列が未解析だったために実施した研究。ゲノム解析に貢献しました。
社会・地域活動
教育活動
| 担当科目 | 海洋生物資源学フィールド演習, 海洋微生物生態学実験, 微生物学概論 |
|---|---|
| オフィスアワー | 9時～17時30分 |
| 相談・講演・共同研究等に応じられるテーマなど | 沿岸生態系の微生物を介した物質循環 細菌捕食性原生成物の単離培養・増殖生理 バイオインフォマティクス（大量塩基配列情報のプログラム言語による処理）・ゲノム解析 分子生物学的手法（リアルタイムPCR法、次世代シーケンシング法） 海産性微生物の群集構造（海産性真核ピコ植物プランクトン・細菌・古細菌について全般、検出と分離） アオコ原因ラン藻の増殖特性（ラン藻の検出と分離、増殖と環境要因の関係） 土壌性原核微生物の重金属代謝（ヒ素やアンチモン代謝細菌類の検出と分離、重金属分析） |